Реклама


SECIS-элемент

Предполагаемая вторичная структура элемента SECIS

SECIS-элеме́нт (от англ. selenocysteine insertion sequence — последовательность вставки селеноцистеина) — участок РНК длиной около 60 нуклеотидов, формирующий шпилькообразную структуру[1]. Этот структурный мотив[en] (набор нуклеотидов) заставляет стоп-кодон UGA кодировать селеноцистеин. Поэтому элемент SECIS является неотъемлемым элементом мРНК, кодирующих селенопротеины (белки, содержащие один или более остатков селеносодержащей аминокислоты селеноцистеина).

У бактерий элемент SECIS располагается почти сразу после кодона UGA, на который он воздействует. У архей и эукариот он находится в 3'-нетранслируемой области (англ. 3' untranslated region, 3' UTR) мРНК, и один элемент SECIS может заставить несколько UGA-кодонов кодировать селеноцистеин. У одного рода архей, Methanococcus, элемент SECIS расположен в 5'-нетранслируемой области (англ. 5' untranslated region, 5' UTR).

Элемент SECIS можно отличить по характерной последовательности нуклеотидов, то есть в нём определённые нуклеотиды занимают строго определённые места, а также характерной вторичной структуре. Вторичная структура обусловлена образованием водородных связей между комплементарными азотистыми основаниями, в результате чего формируется структура, похожая на шпильку. Эукариотический SECIS содержит неканонические пары A-G, которые редки в природе, однако чрезвычайно важны для нормального функционирования SECIS. Хотя и у эукариот, и у архей, и у бактерий SECIS имеет характерную форму шпильки, они не совмещаются друг с другом, то есть порядок расположения нуклеотидов, характерный для эукариотических SECIS, не является таковым для SECIS архей.

Было создано несколько компьютерных программ для поиска элемента SECIS в геноме, их работа основана на поиске специфических последовательностей и элементов вторичной структуры. Эти программы были использованы для поиска новых селенопротеинов[2].

Элемент SECIS обнаружен у самых разнообразных организмов из всех трёх доменов жизни, а также их вирусов[2][3][4][5][6][7][8].

Примечания[ | код]

  1. Walczak, R; Westhof E, Carbon P, Krol A (1996). “A novel RNA structural motif in the selenocysteine insertion element of eukaryotic selenoprotein mRNAs”. RNA. 2 (4): 367—379. PMC 1369379. PMID 8634917. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)
  2. 1 2 Lambert, A; Lescure A, Gautheret D (2002). “A survey of metazoan selenocysteine insertion sequences”. Biochimie. 84 (9): 953—959. DOI:10.1016/S0300-9084(02)01441-4. PMID 12458087. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)
  3. Mix H, Lobanov AV, Gladyshev VN (2007). “SECIS elements in the coding regions of selenoprotein transcripts are functional in higher eukaryotes”. Nucleic Acids Res. 35 (2): 414—23. DOI:10.1093/nar/gkl1060. PMC 1802603. PMID 17169995.
  4. Cassago A, Rodrigues EM, Prieto EL; et al. (2006). “Identification of Leishmania selenoproteins and SECIS element”. Mol. Biochem. Parasitol. 149 (2): 128—34. DOI:10.1016/j.molbiopara.2006.05.002. PMID 16766053.
  5. Mourier T, Pain A, Barrell B, Griffiths-Jones S (2005). “A selenocysteine tRNA and SECIS element in Plasmodium falciparum”. RNA. 11 (2): 119—22. DOI:10.1261/rna.7185605. PMC 1370700. PMID 15659354.
  6. G. V. Kryukov, S. Castellano, S. V. Novoselov, A. V. Lobanov, O. Zehtab, R. Guigó, and V. N. Gladyshev (2003). “Characterization of mammalian selenoproteomes”. Science. 300 (5624): 1439—1443. DOI:10.1126/science.1083516. PMID 12775843.
  7. Gregory V. Kryukov and Vadim N. Gladyshev (2004). “The prokaryotic selenoproteome”. EMBO Rep. 5 (5): 538—543. DOI:10.1038/sj.embor.7400126. PMC 1299047. PMID 15105824.
  8. Alain Krol (2002). “Evolutionarily different RNA motifs and RNA-protein complexes to achieve selenoprotein synthesis”. Biochimie. 84 (8): 765—774. DOI:10.1016/S0300-9084(02)01405-0. PMID 12457564.
Реклама